吉林大学中日联谊医院座落于吉林省省会长春市，是教育部直属高校—吉林大学所属的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的全民所有制大型现代化综合性三级甲等医院，始建于1949年，其前身是中国人民解放军长春医科大学外科学院。经过50年建设，吉林大学中日联谊医院已由单一的外科专科医院发展成为拥有外科学、内科学、妇产科学、神经内外科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、口腔科学、皮肤科学、中医学、实验诊断学、检体诊断学、核医学、影像诊断学等36个临床医技科室及14个教研室的综合性医院。并于1993年成为吉林省正式评审首家达标的三级甲等医院。
1993年，医院由位于长春市朝阳区新民大街的原址迁至由吉林省、长春市政府拨地、卫生部拨款建筑、日本政府无偿援助26亿日元医疗设备的长春经济技术开发区自由大路新址，为感谢日本人民的真情厚意，医院经卫生部重新命名为白求恩医大三院（中日联谊医院）。2000年白求恩医科大学与吉林大学合并后医院正式更名为吉林大学中日联谊医院。新医院占地面积22.8万平方米，建筑面积11万4千7百多平方米，医院设有编制床位952张，拥有2个国家卫生部重点学科（耳鼻咽喉——头颈外科、骨科）5个研究所（吉林省外科研究所、吉林省心血管病研究所、吉林省放射介入外科研究所、吉林省创伤骨科研究所、白求恩医科大学耳鼻咽喉——头颈外科研究所），4个中心（吉林省创伤骨科治疗中心、吉林省人工关节治疗中心、吉林省肾脏移植与血液净化研究中心、白求恩医科大学手外科中心），在编职工1406人，其中教授59人，副教授149人，讲师及相应职称545人，拥有博士学位授权学科5个，硕士学位授权专业25个，博士研究生导师15名，硕士研究生导师84名。现有享受国务院政府特殊津贴人员37名,吉林省管优秀专家、吉林省有突出贡献的中青年专家、长春市有突出贡献的市级专家、长春资深名医、长春名医、长春市跨世纪第一梯队科技干部、第二梯队科技干部共27名。拥有万元以上先进的大型医疗设备900多台（件），设有先进的计算机网络系统，并已加入Internet国际互联网。吉林大学中日联谊医院还是国家级爱婴医院、国家药品临床研究基地、亚洲紧急救援中心和卫生部国际紧急救援中心的网络医院。
由于历年来国家不断为医院充实了大批医学专业人才，其外科优势在东北地区极为明显。1957年我院普通外科成功地进行了国内首例肝极量切除，并于1963年在亚太国际会议上进行手术表演；同年，胸外科体外循环心内直视手术的成功，填补了吉林省在该领域里的空白；1964年断臂再植成功，卫生部发来贺电；1962年至今，耳鼻咽喉——头颈外科开展蝶胺肿瘤经鼻手术的治疗150例；1978年泌尿外科开创了吉林省脏器移植手术临床应用的成功先例，现己开展同种异体肾脏移植手术970例；1982年以来，开展同种异体原位肝脏移植2例；同种异体角膜移植1000余例；心血管内科非手术无水酒精消融治疗肥厚性梗阻型心肌病，达到了世界先进水平。据不完全统计，三院建院50年来共诊治住院患者40.827万人次，相当于长春地区（686万人）平均每16个人中就有一人在三院住过院；1964年至今共接诊门诊患者717.8315万人次，相当于吉林省2656.61万人，平均每3个人中就有1人在三院看过病。目前，三院己逐步形成以外科系统为优势，以心脑血管疾病的诊治、创伤治疗及组织器官移植为主的医疗特色。1996年医院急救中心护理组被吉林省创建青年文明号活动组委会命名为“省级青年文明号”；1997年医院眼科被吉林省卫生厅评为“吉林省职业道德建设先进科室”；1997年医院被长春市卫生局评为“白求恩杯竞赛最佳单位”；1997年医院急救中心护理组被长春市委宣传部、长春市总工会命名为“首批长春市职业道德建设示范单位”；1998年医院被吉林省消费者协会授予“'98'吉林省文明服务单位”、被长春市高工委评为长春市消费者协会评为优质服务最佳信誉单位；1999年医院急救中心护理组被共青团中央和卫生部共同任命为全国青年文明号；2000年医院被社会群众投票评为长春市医疗卫生行业形象大使、被长春市高工委评为“高校文明杯”先进基层单位、被长春市委市政府评为长春市创建文明城市“十杯赛”最佳单位。